五月底至今的悲慘新聞

一直沒啥好消息，所以也沒什麼力氣寫...

最悲慘的事件是大學的室友出車禍過世了，這也促使我想著該更加珍惜現有的一切 — 天天觸目可及的友誼與親情。
接下來連兩悲慘是發現目前實驗中的兩大缺失！！！！！ 幾乎是整個根基全毀..... 只能怪自己當初不夠強硬要求老闆把缺的試劑買回來... 貧窮人家的血淚～～～ 省東省西地就是賠上無價的兩年時間...

看來要離開這鳥地方是遙遙無期了～～

Fox in Fishbowl ~~

今天再下一城～～～

離畢業又進了一步～～ 由於太晚預約會議室，所有有投影機的房間都被約滿了... 只剩兩間沒投影機的... 其中一間就是這"Fishbowl" — 『魚缸會議室』.. 這名字原本認為是大家胡亂取的，後來發現還有滿多地方都這樣叫的！ 由來很簡單，該會議式的兩側是透明玻璃，從外頭可以直接看進裡面～～ 就像魚缸一樣... Orz

Fox's Counterstrike AGAIN! (狐狸的逆襲～～ XD)

入了科學這一行一路走來總是倒吃甘蔗。

'98 入行到了 '02 年才開始突飛猛進，一年內完成兩篇論文的量。 這期間換了六個題目，每次PR總是抬不起頭來、不知道忤逆了老蔡幾多次、四草不知道繞了幾多圈.... 好在在老蔡的耐心與信心下活了過來。

退伍考完後托福與 GRE，在出國前的六個月狀況其實是滿不錯的... 沒想到 '05 年暑假來了米國後，開始了另一輪的低潮期... 也許真的是無法快速切入新領域的思維吧～～ 跟老闆一直無法『思想磨合』 然而去年暑假後 ('08)，實驗開始抓到方向，一步一步把老闆導入預設好的陷阱中。現在 '09 逐漸進入收集 data 的極大期.... 逆襲即將展開～～～～ 四年來的怨氣一定要全部討回來！！！ 如同 2003... History always revives itself!

P.S. (5/1): mini-symposium; (5/27): advisory meeting; 2009 Fall: pre-lim

近況報導...

開學以來一直都很忙，忙實驗、忙教課、忙個不知所以然的 coding... Orz

先說這 perl coding 好了，由於這基因註解是最後一階段的『人工校對』，所以想單然爾... 大家對於大規模的自動化註解並不是太有興趣...，反正也不是自己的 project 或是實驗室.... 沒必要拿自己的冷屁股去貼別人的熱臉... （現在是冬天呢...XD）

教課方面，由於是教第三、四次了 （上學期帶了兩班，這學期也是兩班），已經麻木了... 喔！！ 是駕輕就熟！！ 小朋友哪根毛會痛～～ 都已在我的股掌之間... XD 不過還是很累啦～～ 已經連續兩個星期上了扎扎實實的六小時課了...

實驗室呢？ 面臨關門之際.... XD XD 一月底剛走了『師姐』... 師兄今年中或年底也要走了；加上師兄家裡最近比較忙，剩下我跟老闆兩個人在實驗室裡乾瞪眼... XD 昨天才又去找他吵了一架... 真是爽阿！ 沒吵沒溝通，吵了就有共識啦～ 算是有進展吧！ Orz 年中老闆就要審 tenure 啦～～ 萬一沒過... XD 我就是『關門弟子』啦！！

忙雖忙，該過的節日一個都沒少...

湯圓節

情人節去吃了『美式自助餐』... XD 果然是差了中式的一大截，不過我是還可以接受啦！ 麵包挺好吃的... XD

情人節應景的布景... Orz 滿多人在看的，拍完馬上閃人..

阿波羅 - Apollo

這學期去淌一堂課 ( workshop-based ) 的渾水～～～ 四學分.... Orz
基本上就是做基因的註解，這工作看似簡單？！ 但其實有著許多人為、主觀、不客觀、不科學的偏見存在。十個人做同一個基因會有十個以上的結果。這基本上是違背我的工作原則的，我可以接受一致程度的主觀，但非選擇性的主觀....

我們使用的軟體是阿波羅『太陽神』，它其實提供了非常不錯的視覺化介面來展示現有序列證據與可能的註解。所以，它只是一個工作的介面.... 大量人力工作的平台... Orz

既然需要人工投入加上又是重複性的判斷工作，那有沒有用電腦取代呢？ 嗯嗯～～理論上是可以吧？！ 不過人腦加上圖形的連結，判斷起來是快（慢）多了...

寫成程式就更慢了！ Orz 希望 Aurora 最後可以成為 Apollo 的好朋友～～

Equipments in Other's Lab are BETTER?!

又去別人家胡搞了～～

嘿嘿～～ 從以前到現在總是會跑去女王家的實驗室 (SUNNY Lab) 用儀器～～ 來到香檳後... 依然如此... Orz 是怎樣？！ 怎麼老是自個家沒好用的咚咚呢？？？？？


這次去用的儀器到也不是不常見的儀器，但我們家就是沒有阿！！！！ Nanodrop 還真是個好物阿！ 跟傳統的分光光度計相比有著許多優勢，最明顯的就是不用稀釋 samples 啦～～ 哈哈哈～～ 可以節省很多時間。 二來不用洗 Cuvette，也是節省時間阿～～ 第三點『節省 samples』就見仁見智了，我也是可以用 2+78 在傳統老機器測～～ （當然濃度很低的，還是 nanodrop 比較強）

又想順便抱怨一下自個實驗室～～ 唉～～ 就不過是 30 個 samples 要跑個 2% 洋菜膠的電泳槽也沒合用的..... Orz 明明 50 c.c. 的就能解決，雖然可以插兩排 comb，但 但 但～～ 他媽的我們家就是只有一組 Comb 勒！！！ （我們家就是做蛋白質的，其他東西我們都缺啦～～ Orz） 他媽的死腦筋～～ 省小錢，花大錢～～ 告訴你大錢怎麼花！！！ 350 ml 2% 洋菜膠 -> 7 克... 大失血了吧？？？！

按～～

Official announcement

總算拿到所裡發的正式文件啦～～～ 正式成為『博士候選人』... 一點都沒高興的感覺，苦日子要來啦！

欲素則不答

想要我吃素的，我就不答話！！！！

按～～～ 是『欲速則不達』啦～～～ 資格考後的兩星期，連趕了三大批實驗，結果批批各有小細節出差錯，一來一往每批實驗都是要花上六至七天的。 『時間、金錢、人力』一樣都沒有沒浪費到.... Orz
還是別太貪心好了～～～

OMX !!! Orz?!

昨天mi了三小時多就算了，還接著去跟 confocal 玩了另外三小時，眼睛都快脫窗了～～ 其實，三天前就該去用confocal了，無奈『機房』正在安裝新咚咚！！！ 啥麼新咚咚呢？？？？ 正是『OMX』阿！ 乍看之下很像『ORZ』... 噗～～


OMX 其實是 Optical Microscope eXperimental 的縮寫，最早由 UCSF 與 UCDavis 共同研發，相較於一般的光學顯微鏡據稱有10倍的解析度 （實際數據為 50 nm，約為5倍左右）。這個改進對於細胞生物學將有多大的幫助？ 這我不敢說... 要看研究生有沒有認真做實驗... XD 附帶一提，OMX 已研發成功，並完成商業化了 — 意思是： 錢買的到了！！！！

另外，要讚揚一下 CDB 的新系主任，沒有他，我想 MCB 恐怕不會有這台新機器。

廢話不多說！ 賞圖重要～～～ 以下是自 Center for Biophotonics @ UCDavis 轉貼的
可以見識到 OMX 的確大幅提昇解析度！！

這是目前安裝在 CLSL 的 OMX：
右側蓋藍套子的是 LSM510；中間的黑機房是 OMX 的雷射光源。 LSM510 的雷射光源跟 OMX 一比，根本是小巫見大巫！！

機房外有貼危險標誌喔！

最後，有興趣了解原理的請看：
Nonlinear structured-illumination microscopy: wide-field fluorescence imaging with theoretically unlimited resolution
Gustafsson MG
Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 Sep 13;102(37):13081-6

The result!

XD.. after a long marathon of meeting with my boss (~3.5 hr), he checked his e-mail before leaving. Suddenly he said "I got a bad new !!!! KY! you pass it!!".. XD

Wired Dept, they even didn't send me an e-mail to infrom the result, but send to my boss in the last minute before Turkey break????

Burn the midnight Oil

Burn the midnight oil at the first night of the turkey break....
However, I screwed it up... Damn machine !! I think it should be filtered!

My Xmas Gift ?

今天實驗室前送來一個大箱子... 應該是『新的』二手機器到了～～ 故意問了克雷格裡頭是裝啥龜.... XD 他居然說是我的聖誕節禮物... Orz 最好是啦～～ 那表示資格考完有的忙了...

50% Done

總算是趕上了～～～ 接近四點時，把 proposal 交到所辦去～～ Orz 走在路上還發現有一頁頁碼印錯了... 啊啊～～ 來不及重印啦！！

NICE but 肉腳的超慢郎中

我們家老闆是年長版的研究生，啥都拖到最後一刻才做而且做的很趕，又做不完... Orz 即便早早把 proposal 給他，他還是拖到這星期一才開始改，改到今晚八點多才寄給我初稿... 吐血的是還只改了不到二分之一... 真是(嗶～)你老師的慢龜仔.... 還跟我補了一句『明早前，我會改完！』。 (嗶～)～ 費言，我明天下午四點前要交啊！

Empty Lab

ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ

ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ ㄕㄨㄤˇ
老闆出遊外帶兩個實驗室成員一起去... under也沒來...
5-1-2-1=1

XD 剩我一個人留守耶～～ 哈哈哈～～

XD ～～ 阿不就跟平常週末差不多～～ 是在爽啥？

該哭還是該笑？

事情不能做半套... Orz

又該死地印證了一次～～
話說上次 ( 去年 12 月 ) 的抗體經過純化後，在 ELISA 與 ChIP 中的測試效價與專一性皆無改善... 於是這抗體從此被我打入冷宮... 我也因而啟始了現在這個實驗..

『在 ELISA 與 ChIP 與效價與專一性皆無改善』，這個敘述是很強烈啦～ data 也都是真的... 但這真的不是『全套』... 其實有著很嚴重的『bias』...

今天把 IF 做完了，看了結果後... 當場倒在 confocal 前... 其實，純化完的抗體是有改善的！！
前兩組的實驗都是有盲點的！
1) ELISA 都是 positive control，廢話！ 當然看不出來非專一性結合減少了！
2) ChIP ？ 你老師的勒！ 根本是個 Novel modification，沒人知道在哪裡！ 錯的位置～ 看起來當然沒差..

該哭還是該笑？


















當然是笑囉～～～
準備被老闆笑.... Orz
看來又多拉了一條戰線啦......

砍砍砍掉重練～～～

今天為了『應景』給老闆看初稿，proposal 一整個亂寫... XD
晚上看了一下，太雜亂啦(方向太多、太複雜、野心太大)～～ 另開新檔，砍掉重寫！

夜間作戰

這一星期天天都是三四點才睡，彷彿回到剛來 US 的日子。

晚上的效率倒也不是特別好，但卻是唯一可以不做實驗的時段... Orz 白天在學校總是會手賤，一直去搞實驗來忙。因此就無法專心在讀文獻上。適時的停下實驗室總是需要的，重新整理思緒與方向才不會一頭鑽錯巷子.. XD

星期三順便完成了一份『說帖』給老闆... 就怕他沒時間看。所以，這星期也幾乎天天都在跟老闆『盧』... 『盧』說該來做些什麼事～～

不過『正經』的事還是得做，十月十五日快到囉～～ 再不趕工寫計畫，就來不及囉～ 加上老闆九月裡，有兩三個星期不在... 能不能找到人修改還是個問題勒！！！

按～～

按～～

我真是天才！！！ 想到一組天衣無縫的新實驗！！！ 趕緊得找時間來種細胞～～～

偷懶不得

結論還真是不可太早下！
昨晚搞到三點， 180 張照片量化到只剩一組時間點，那趨勢看起來還真是令人沮喪... 鬱鬱寡歡地去睡覺... 結果一早把僅剩的第一點時間點補上... 噹噹噹～～～

一切馬上變得合理啦！！ 哈哈～～